在这部伏羲传奇之五行灵玉动画/儿童片中,故事要从水神共工和火神祝融大战开始讲起，(水神共工觊觎祝融的神火，设计盗走了它，祝融与之大战，致使双方两败俱伤,神力尽失)共工发誓要让所有的陆地变成海洋，而伏羲偶然间发现了火种，唤醒了祝融，得到祝融的指点，在女娲，神农的帮助下，去搜寻上古灵玉(灵玉：五行之说，金灵、木灵、水灵、火灵、土灵)，召唤龙马白龟，得到【河图洛书】共同对抗共工。
伏羲凭借不畏艰险、顽强勇敢的心，踏上了神奇的探索之路。与此同时，共工的手下相柳，浮游也在一路上设置了层层障碍，阻碍着伏羲的前进的道路。在冒险的过程中，伏羲不仅寻找到了【河图洛书】,更创造了诸多的华夏文明。 [1]
本片是围绕华夏文明始祖伏羲的伟大功绩来发展的，是一个神话故事类的题材。五千多年前出现的伏羲文化是中华文化与文明的源头，今天的华夏民族的灿烂辉煌，是如何一步一步积淀和深华的，是我们华夏子孙需追本求源的过程。
